由于特殊的地理位置和自然环境，长白山有多种植物区系成分，包括长白山植物区系、南鄂霍次克植物区系和极地植物区系，此外还有华北区系、蒙古区系及亚热带植物区系的植物种，几乎分布从温带到北极的全部典型植被类型及相应的植物区系成分，是欧亚大陆同纬度地区原始状态保存最好、生物物种最丰富的地段，是不可多得的生物遗传基因库。
区内植物种类十分丰富，目前已知有野生植物(包括地衣、苔藓、蕨类、裸子植物、被子植物)种4亚种变种45变型，分属于74目科属。在维管束植物(蕨类、裸子植物、被子植物)中，东北地区共有科属种，而长白山就占东北地区维管束植物种类的40.9%。
长白山区野生植物中，国家珍稀危植物有23种，其中，国家级保护植物有人参、东北红豆杉和长白松3种；国家Ⅱ级保护植物有岩高兰、山楂海棠、对开蕨等20种。
1)材用植物，主要有红松、云杉、臭松、落叶松、水曲柳、胡桃楸、黄菠萝、椴树、槭树、蒙古树、白桦、枫桦、榆树、赤杨等。
2)药用植物。主要有人参、党参、东北刺人参、黄芪、贝母、木通、细辛、天麻、瑞香、五味子、红景天、云芝、松杉灵芝、草蓉等。
3)食用植物。主要有山果类、野菜类、真菌类等，主要有山楂、山荆子、蓝靛果、花盖梨、山葡萄、越桔、猕猴桃、红松籽、榛子、分株紫萁、蕨菜、龙芽楤木、大叶芹、木耳、榛蘑、亚侧耳(冻蘑)、猴头蘑、金顶侧耳(榆黄蘑）等。野果既可以鲜食，又可以酿酒、制作罐头和饮料，这些植物不仅味道鲜美营养价值高，而且还具有一定的观赏价值。
笃斯越桔
4)观赏植物。主要有偃松、玫瑰、花楸、八角枫、金露梅，长白松、接骨木、朝鲜崖柏、杜松、暴马丁香、梨树、东北山梅花、杜鹃花属、百合属等，这些植物都深受学者和旅游观光者的重视和青睐。
5)蜜源植物，主要有紫椴、糠椴和胡桃楸等，松科的花粉也是一大特色，是发展养蜂业的重要基地之一。
6)香料植物。主要有野玫瑰、长白蔷薇、长白瑞香、藿香、月见草、蚊子草、朝鲜崖柏等，它们是食品、日用化工的重要原料。
